生物信息学课程

基础知识

分子生物学和细胞生物学

参考课程:

《Bioinformatics Data Skills》——讲得基础。印象最深的是介绍find + xargs + parallel用法,至今受用,其他忘了。

《高通量测序技术》——李金明。介绍高通量测序在临床基因检测中的应用。

《生物信息学与功能基因组学》——非常好的入门教材。

《北京大学生物信息学在线课程》——偏重算法。

《山东大学生物信息学在线课程》——我没看过,但很多人推荐。

《陈润生院士中科院生物信息学课程》——课程虽然有点老(07-08年的),但讲解的知识现在也不过时。我当年主要看这个课入门,其次是北大的课。

生物信息学:如何用AI分析和挖掘生物大数据

生物信息学是一门跨学科的科学领域,它将生物学、计算机科学和统计学等多个学科的知识相结合,利用计算方法和工具来解决生物学领域的问题。随着生物学数据的急剧增加,人工智能(AI)技术在生物信息学中的应用变得越来越重要。本文将介绍如何利用AI技术分析和挖掘生物大数据。

1.生物信息学的基础知识

在介绍如何用AI分析和挖掘生物大数据之前,我们需要了解一些基础知识:

  • 基因组学:研究生物体的基因组结构和功能。

  • 转录组学:研究生物体的转录产物,如mRNA的表达情况。

  • 蛋白质组学:研究生物体的蛋白质组成和功能。

  • 表观基因组学:研究基因组中的表观遗传学变化,如DNA甲基化和组蛋白修饰等。

    2.AI在生物信息学中的应用

    (1) 生物数据分析
    AI技术可以应用于生物数据的分析,例如:

  • 序列分析:利用机器学习算法对基因序列、蛋白质序列等进行分析和预测。

  • 结构预测:利用深度学习算法对蛋白质结构进行预测,从而推断其功能。

  • 功能注释:利用机器学习算法对基因、蛋白质等的功能进行注释和预测。
    (2) 生物数据挖掘
    AI技术还可以应用于生物数据的挖掘,例如:

  • 基因表达模式分析:利用聚类、关联规则挖掘等技术,分析基因的表达模式。

  • 基因网络分析:利用图论和复杂网络分析技术,研究基因之间的相互作用和调控网络。

  • 药物发现与设计:利用机器学习和深度学习算法,预测药物的活性、毒性等性质。


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